Свети Йоан Милостиви е роден в град Аматунда на Кипър (сега близо до Лимасол) през 556 г. Той бил син на заможни родители и сам основал семейство, но скоро след това загубил съпругата и децата си. Вместо да си направи ново семейство, решил да посвети живота си на Бога. Станал свещеник и много се грижил за нуждаещите се. През 610 г. заради своя пример и образованост бил избран за патриарх на Александрия, а изборът му бил подкрепен дори от византийския император Ираклий.
В Египет свети Йоан се проявил като отдаден и милостив пастир. Той верно следвал учението на Иисус Христос и вложил много усилия и средства, за да помага на Църквата в грижите за бедните и страдащите: организирал кухни, сиропиталища, старчески домове и болници. Със своето милостиво и състрадателно поведение успял да стане пример за всички свещеници и вярващи, което му донесло прозвището Милостивият.
Бил изключително уважаван дори от нехристияните, тъй като се грижел за всички нуждаещи се, независимо от тяхната вяра или произход. Освен това притежавал дълбока смиреност, за което са запазени различни истории. Веднъж свети Йоан разбрал, че един църковен служител е огорчен от наказание, което макар и справедливо, го засегнало, и решил сам да уреди отношенията си с него. Незабавно изпратил да го повикат, поклонил му се и поискал прошка. Смирението и добротата на патриарха толкова развълнували служителя, че той паднал на колене в разкаяние и двамата се помирили.
Когато персите нападнали, патриарх Йоан бил принуден да напусне Александрия. Той се отправил към Цариград, но решил да премине през родината си – остров Кипър. Там осъзнал, че приближава краят на живота му, затова се отправил към Аматунда, където се приготвил за смъртта и тихо предал душата си на Бога през 619 г.
